สารประกอบที่รับผิดชอบต่อกลิ่นลักษณะเฉพาะถูกระบุว่าเป็น (-)-(S)-citronellal ซึ่งมีอยู่มากถึงร้อยละ 80 ของน้ำมันใบ ส่วนผสมรองลงมา ได้แก่ ซิโทรเนลลอล (10%) เนรอล และลิโมนีน จากมุมมองของสเตอริโอเคมี ใบมะกรูดมีเพียง (S) สเตอรีโอไอโซเมอร์ของซิโตรเนลล์ ในขณะที่อีแนนทิโอเมอร์ (+)-(R)-ซิโทรเนลล์พบในเลมอนบาล์ม และ (ในระดับที่น้อยกว่า) รวมอยู่ในทั้งสองอย่าง ตะไคร้ (แม้ว่าตะไคร้หอมจะเป็นเพียงส่วนประกอบเล็กน้อยของน้ำมันหอมระเหยชนิดหลังก็ตาม) เปลือกผลมะกรูดมีน้ำมันหอมระเหยเทียบได้กับน้ำมันเปลือกผลมะนาว ส่วนประกอบหลัก ได้แก่ ลิโมนีนและบีตา-พีนีน ความเป็นพิษ ประโยชน์ของมะกรูด C. hystrix มี furanocoumarins จำนวนมากทั้งในผิวหนังและเยื่อกระดาษ Furanocoumarins เป็นที่ทราบกันดีว่าทำให้เกิดโรคไฟโตโฟโตเดอร์มาติสซึ่งอาจทำให้เกิดการระคายเคืองผิวหนังอย่างรุนแรง มีรายงานกรณีของ phytophotodermatitis ที่เกิดจากการใช้ C. hystrix เฉพาะที่ ดูสิ่งนี้ด้วย อนุกรมวิธานของ Citrus – อนุกรมวิธานทางพฤกษศาสตร์ของสกุล Citrus